Нарастающее загрязнение атмосферы и антропогенное изменение окружающей среды дают основание рассматривать экологию не только как фундаментальную биологическую науку и междисциплинарную область знаний, но и как научную базу системы мероприятий по охране окружающей среды и здоровья населения, что в полной мере относится и к экологической патофизиологии, а также к иммунологии. Экологическая иммунология, как новое научное и учебное направление сталкивается с комплексом социально-биологических проблем. Центральной из них является создание теории и практики экологической иммунологии, которые должны исходить из следующей концепции - нормальное функционирование иммунной системы человека и животных возможно только при сохранении разнообразия природных антигенов, определяющих готовность иммунной системы к реагированию. Поэтому охрана природы необходима не только для защиты животного организма от воздействия вредных факторов, но и для его нормальной жизнедеятельности. При этом следует иметь в виду, что нормальное развитие и функционирование биологического индивида возможно только при поддержании интенсивности антигенного воздействия на оптимальном физиологическом уровне, что возможно лишь при сохранении естественных биоценозов. Изменения, происходящие в биосфере, приводят к нарушению молекулярных процессов в иммунной системе или регуляции этих процессов, что суживает эколого-физиологические возможности адаптации человека к условиям среды обитания, а это является одним из условий, способствующих развитию болезни. Следовательно, такие проблемы, как адаптация, резистентность, экология, иммунитет, тесно взаимосвязаны, взаимообусловлены, и являются предметом изучения экологической патофизиологии. Поэтому, изучение иммуно-экологических связей, закономерностей функционирования и ответных реакций иммунной и других регуляторных систем при взаимодействии человека с разными экологическими факторами позволит обеспечить экологическую безопасность человека. Развитие экологической патофизиологии и иммунологии тесно связано с существенным ухудшением экологической ситуации во многих регионах, влиянием на организм человека неблагоприятных факторов антропогенного характера и возрастанием заболеваемости населения, связанной с воздействием на человека этих неблагоприятных факторов, которые часто являются иммунодепрессантами, аллергенами или кофакторами иммунопатологии. Иммунная система (ИС) является высокочувствительной к воздействию различных антропогенных факторов. Это становится одной из причин существенного роста заболеваемости, связанной с нарушением иммунорегуляторных процессов. Такие нарушения могут вести к росту распространённости инфекционных, аллергических, аутоиммунных, лимфопролиферативных, опухолевых и многих соматических заболеваний, в патогенезе которых определённую роль играют иммунные механизмы. ИС может выступать как показатель воздействия на организм различных антропогенных факторов, являться чувствительной индикаторной системой наличия в регионе экологически неблагоприятной ситуации.
Таким образом, экологическая патофизиология, включающая экологическую биохимию, иммунологию, гематологию, микробиологию и другие медицинские направления - это наука и учебный предмет, изучающие влияние факторов внешней среды на организм человека. Главной задачей экологической патофизиологии является донозологическая диагностика экологически зависимых заболеваний человека, профилактика развития нарушений регуляторных механизмов. Цель экологической патофизиологии - улучшение экологических условий и повышение уровня здоровья населения в стране.