Разработана комплексная программа мер по совершенствованию процесса воспитания студентов, которая содержит важнейшие и приоритетные целевые установки по основным направлениям: духовно-нравственное, гражданско-патриотическое, правовое, экологическое, культурно - досуговое. В программе раскрыты основные пути и механизмы реализации воспитательного процесса на уровне факультетов, кафедр и органов студенческого самоуправления, определены критерии эффективности воспитания по основным направлениям.
Механизм реализации процесса воспитательной деятельности в университете обеспечен Положениями, пересмотренными и дополненными в свете новых нормативных требований. С целью совершенствования учебно-воспитательного процесса издано методическое пособие «Концептуальные основы технологий и социальной поддержки студентов в медицинском ВУЗе».
В университете создан и функционирует Совет по воспитательной работе, в состав которого входят руководители структурных подразделений, органов студенческого самоуправления, заведующие кафедрами, преподаватели, имеющие большой опыт воспитательной работы, представители студенчества. Совет строит свою работу на основе Положения, утвержденного Ученым советом университета.